1、苯酚氯仿法
苯酚氯仿提取DNA是利用酚是蛋白質的變性劑,反復抽提,使蛋白質變性,SDS(十二烷基磺酸鈉)將細胞膜裂解,在蛋白酶K、EDTA的存在下消化蛋白質或多肽或小肽分子,變性降解核蛋白,使DNA從核蛋白中游離出來。而DNA易溶于水,卻不溶于有機溶劑。蛋白質分子表面帶有親水基團,也容易進行水合作用,并在表面形成一層水化層,使蛋白質分子能順利地進入到水溶液中形成穩(wěn)定的膠體溶液。當有機溶液存在時,蛋白質的這種膠體穩(wěn)定性遭到破壞,變性沉淀。離心后有機溶劑在試管底層(有機相),DNA存在于上層水相中,蛋白質則沉淀于兩相之間。利用萃取原理,根據(jù)蛋白核酸溶于不同的試劑層,將槍頭伸入不同液層內抽取所需的成分,經多次洗滌后獲得純化核酸。
優(yōu)點是采用了實驗室常見的試劑和藥品,做起來成本比較低廉。
缺點是由于使用了苯酚、氯仿等試劑,毒性較大,長時間操作對人員健康有較大影響,而且核酸的回收率較低,損失量較大,由于操作體系大,不同實驗人員操作重復性差,不利于保護RNA,很難進行微量化的操作。4、硅膠膜離心柱法
此種方法是利用核酸表面會覆蓋一層由水分子構成的薄膜,在高鹽環(huán)境下,這層親水膜會遭到破壞從而核酸可被吸附在離心柱上,而其他雜質如蛋白質、代謝產物等則會被離心沉淀與核酸分離。最后通過洗脫,將核酸從吸附膜上脫離,即可得到純化后的核酸。離心柱純化也是的試劑盒提取中廣泛的使用方法。
但即便如此,離心柱純化法仍存在缺點:高度依賴吸附膜的結合能力;洗脫不完全導致核酸流失;無法大量提取核酸。
5、磁珠法核酸分離技術
攜帶正電荷的磁珠易于吸附負電荷的核酸,主要用于從人血清或血漿樣品中提取DNA 和RNA(例如從血液樣本中檢測HIV 或HBV 病毒基因組的樣品制備)。一般而言,將樣品與結合緩沖液和磁珠混合,核酸與磁珠結合后,經過數(shù)次洗滌與磁場捕獲,洗脫下來的核酸即可通過PCR 或其它特定方法來檢測特定的DNA或RNA。磁分離法也是廣泛應用于診斷行業(yè),且能實現(xiàn)高通量、自動化的核酸提取方法。
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